在國家稅務總局2013年開展的藥品、醫療器械生產經營單位和醫療機構發票使用情況的專項整治活動中，上海市S區稅務局稽查局成功查處一起A醫療有限公司（以下簡稱A公司）違規作廢增值稅普通發票的案件，涉案金額近400萬元。

　　在核查2010年和2011年H醫院采購信息及銷售方開票信息時，檢查人員發現，供貨商A公司每個月開給H醫院的發票中都有作廢發票，H醫院把絕大部分作廢發票都已列支成本。是巧合，還是有意為之？檢查人員就此展開深入檢查。

　　A公司1995年11月注冊成立，注冊資本50萬元，注冊類型為私營有限責任公司，主要經營醫療器械產品批發零售，是增值稅一般納稅人。該公司年銷售收入比較穩定，平均年銷售額約200萬元，此前未受過稅務行政處罰。

　　檢查人員到A公司，獲得了公司合同、開票數據及其他相關資料。初次詢問過程中，A公司法定代表人J某矢口否認存在違規作廢發票的情況，稱由于醫院要求貨物和發票同時送達，經常會發生開票金額超過醫院部門當月預算額度的情況，因此被要求退票重開。

　　當檢查人員試圖核對A公司記賬憑證及銀行日記賬時，J某抗拒地表示，這些資料大都已經遺失。于是，檢查人員再次來到與A公司業務往來最多的H醫院，開展外圍調查取證工作。檢查人員了解了H醫院采購該公司醫療器械的業務流程和付款情況，采集了H醫院收受A公司所有發票信息。經查，A公司供貨至醫院同時開出發票，醫院根據發票聯金額支付貨款，退票重開的情況雖有發生，但比例很小。檢查人員將H醫院受票信息與A公司開票信息導入數據庫，運用技術手段分析比對，整理后的數據顯示，H醫院已入賬列支成本的增值稅普通發票中，A公司擅自作廢154份，累計不含稅金額達255萬元。

　　檢查人員得知A公司還專門為H醫院的貨款往來在S銀行N支行開立了一般賬戶，于是按程序申請調閱A公司在S銀行N支行銀行對賬單，并與H醫院采購入賬信息比對，鎖定A公司真實的銷售金額。同時，檢查人員調查詢問A公司業務員，從票、貨、款三方面取證固定了相關證據。J某無法再自圓其說，只得承認了違規作廢發票的事實。但J某一再強調，H醫院為其最大的客戶，違規作廢發票的情形只存在于對H醫院的業務往來中。

　　事實真相是否如此？檢查人員整理A公司原始銷售記錄，并對A公司在S銀行另一支行開立的基本賬戶逐筆核對收入，梳理出全部貨物和發票的流向，最終發現，該公司在將醫療器械銷往其他醫院和外地客戶過程中，同樣存在違規作廢發票的情況。A公司為避免一次性作廢發票數量過大或銷售額、稅負率異常波動引起稅務機關懷疑，每個月只作廢幾份發票，作廢發票的日期不固定，發票號碼也不連號，但每份發票的金額均在萬元以上。經匯總統計，共計211份增值稅普通發票在購買方列支成本后被違規作廢，累計不含稅金額近400萬元。

　　根據稅法相關規定，稅務機關對A公司追繳稅款及附加稅費、加收滯納金、處罰款等共計約150萬元，同時以涉嫌逃避繳納稅款罪移交司法機關作進一步處理。