分類通關改革就是海關綜合貨物和企業信息，對低風險貨物的報關單證由計算機快速審核，與之相反，高風險貨物的報關單證則由海關實施重點審核，貨物也將被重點查驗。2009年5月，海關總署決定在北京、天津等15個海關開展出口貨物分類通關試點改革，15個海關于6月底開始相繼在本關區出口現場啟動了分類通關改革試點工作。隨后進口分類通關改革試點又在黃埔等海關進行。

　　分類通關改革在給誠信企業帶來通關提速的同時，也使海關的監管更加有效。在15個試點海關中，2009年下半年月平均查驗量比改革前的上半年提高了61％，海關查驗力量集中在高風險貨物，也使海關的查獲率大幅提高。